我們或許都曾經歷過一段不想長大的時期，奮力反抗，最終卻仍是輸給了時間，提起腳步，慢慢的成為了大人，而唯一一個成功永遠停留在童年的人，是那個會飛的小男孩：彼得潘。
但在彼得潘學會飛翔前的故事呢？是單純的不願意長大，還是另有故事？《潘恩》給了我們另一種可能。
電影開頭的色調昏暗，背景設在二戰時期，彼得是孤兒院令修女頭痛的頭號人物。他活潑、好動，有許多鬼點子，純真無畏，敵軍空襲時甚至不去防空洞，反倒與小尼一起去院長室尋找懷疑被院長偷走的配給，卻意外發現隱藏在其中的檔案室，找到了自己的檔案，發現了多年前母親留給他的信。而信卻在院長發現他們的搗蛋後被無情撕毀，彼得和小尼更因此吃了一頓板子。
但懲罰並沒有使得彼得變的乖巧，他隨即又坐在床上與小尼討論起近來孤兒頻頻消失的狀況，認為消失的孤兒並不是去了加拿大避難，而是被院長賣掉了！於是和小尼協商半夜躲起來查看端倪。等到晚上，果然有詭異的事情發生了，天花板被打開，而海盜打扮的人懸著一條繩子，把男孩們一個個從床上抱著帶走了！小尼和彼得也不例外，但小尼鼓起勇氣在海盜船起飛的時候跳了下去，彼得卻沒來得及跳下，於是便和其他男孩一同被帶向未知的世界。
未知的世界色彩繽紛而奇妙，那些綁架他的海盜稱這裡為「夢幻島」。而這裡的老大叫做黑鬍子，壓榨他們在礦坑工作，彼得才第二天就被誣陷為小偷，要被處死，可當黑鬍子將他從高空踹下以為自己要一命嗚呼時，彼得睜開眼，發現自己竟飛在空中！故事打開了序幕，所有人都說，彼得是預言中打敗黑鬍子的那個人，是仙子王子與人類女孩的兒子。彼得找到了自己的身分，他終於接近他一直盼著的母親，卻也疑惑自己真的是那個人嗎？
另一方面，礦場中多年來一直想要回家的虎克終於看到離開這裡的一線生機，於是夥同彼得和史密逃出礦場，卻失敗落在礦場外的森林中，遇見了想要打敗黑鬍子的原住民們。在原住民看見彼得掛在脖子上隨身攜帶的潘笛後，要求彼得在三天後飛翔，證明自己的身分。
彼得卻一直懷疑自己真的是那個人嗎？從一名不知道自己身分的孤兒，搖身成為夢幻島的救星，甚至不清楚自己到底怎麼能飛……巨大的資訊幾乎將他沖垮。我們都希望自己是特別的那一個，但當身邊的人都說你很獨特，我們不禁懷疑：「為什麼是我？我足夠特別嗎？」或許故事的人物受了太久的壓迫，他們都忘了，不論預言怎麼說，彼得終究還是個孩子。
但他在前往仙子國度時經過的湖水裡看到了母親奮戰的身姿，決定了要挺身而出，在最終黑鬍子使計到達仙子的國度之時，虎克於打鬥中從高空中摔下，彼得為了救他義無反顧地跳下。
彼得終於成功的飛了起來，救了虎克，也一如預言的打敗了黑鬍子。他終於找到，也認同了自己是誰。而那正是我們每個人在生命的旅程中，所尋覓的答案。